Село Ягодина се намира в планински район, в близост до Триград. То е разположено в Западните Родопи. В землището на селото попадат част от Буйновското ждрело и част от Триградското ждрело. Селото е известно с Ягодинската пещера, която се намира на 700 метра надморска височина. В Ягодина, както и в околността са построени множество хотели, вили и къщи за почивка.